大鹏清醮一般在大鹏所城的天后庙布置醮会祭坛。请道士或僧人带领乡民，到东山寺请观音，到水神庙请水仙姑，到城隍庙请城隍爷，到太公庙请太公及五显华光诸神，建坛进表。舞狮子、麒麟，燃放爆竹，祭拜诸神，祈求保佑。此后数天早朝幡，礼忏，诵经，拜祭，吃斋，拜斗（道教中一种为人消灾解厄、祈福延寿之科仪，因北斗星君掌消灾解厄，南斗星君掌延寿施福，故消灾祈福、祛病、延生常向南北斗礼拜），祭幽（超度各类孤魂野鬼），晚朝幡。若请的是道家还要举行“抢包山”活动。
祭仪结束后举行游神活动。由僧人或道士引路，乡村中长者带头簇拥天后妈祖等神像，童男童女两人擎着“掌扇”，村民打扮成“八仙过海”中的八仙，狮子、麒麟、锣鼓等跟随其后，在大鹏城内各个村子巡游。从醮坛至村子沿途连接着数千米的爆竹，爆竹声和锣鼓声震天价响。为及时通知下个村子，有位穿古装、佩长剑、骑白马的人提前飞报，被称为“报主”。
醮会结束前人们将各路神像护送回庙观，在海边焚化各式纸扎物件，如纸人、纸马、纸龙、纸鸡、纸船、纸轿、纸塔等以及各式纸制金银财宝，多不胜数。最吸引眼球的是高达两三米的“山大佬”（大鬼王，一说观音化身，为纸扎偶像），狰狞威武，体现出此地军民世居而形成的浓厚的军事文化特征。醮会结束之日开斋吃荤，杀猪宰羊，宰鸡鸭，磨豆腐，大摆“将军宴”，欢聚一堂。“将军宴”是大鹏清醮特有的大型传统宴会，原来是将军凯旋归来，与民同乐，八大菜八小菜，全城欢庆的习俗，后来在醮会结束日也摆“将军宴”，习而成俗。
